流水號
51637
課號
AniSci2022
課程識別碼
606 62050
無分班
- 3 學分
必帶
動物科學技術學系
動物科學技術學系
必帶- 林恩仲
- 搜尋教師開設的課程
生物資源暨農學院 動物科學技術學系
eclin01@ntu.edu.tw
- 動科系加工館三樓 301 室
02-33664148
- 因為個人中學時代愛好數學,又在大學時代接觸電腦運算,雖然畢業退伍後第一個工作是在大醫院中進行癌症免疫相關研究,得以學習眾多以往在學校沒操作過的實驗技術與文獻閱讀因而獲取許多寶貴的實驗數據及經驗,但是也有更多機會接觸統計分析,從此迷上統計學當中所使用的數學語言。 能夠使用電腦軟體去操作各種統計分析,解開實驗桌上所得數據的背後意義,讓我覺得科學是非常有趣的謎語,就像在迷宮裡面憑著推理去解開每一道關著的門,每當打開其中的一道門就頗有成就感,也能夠更有氣力繼續邁步前進去打開下一道門。 後來要出國唸書時,就乾脆申請動物科學(Animal Science)當中與統計最有關係的數量遺傳與動物育種,雖然我個人在此領域中當時沒有什麼強而有力的背景與成就,只是憑著一股強烈的興趣,不斷地與各優秀動物科學系所聯繫,最後去到Iowa State University的動物科學系(Dept. of Animal Science),這是世界上數量遺傳與動物育種的重鎮之一,在那裡接受數理統計、數量遺傳、育種理論/應用、以及電腦科技的洗禮,那真的是從裡面洗到外面,連晚上睡覺都會想到矩陣轉換、統計方法、遺傳統計等內容。在博士班的研究工作建立了Heterogeneous Mixed Linear Model的計算方法,並利用貝氏方法(Bayesian method)進行參數估計,這一成果獲得Iowa State University的傑出研究獎。 如果說在研究所讀書的日子是學術基礎建造,那麼回到台灣的第一個工作單位--台灣動物科技研究所(Animal Technology Institute Taiwan),則是遺傳、育種、數學統計應用的開端。我從豬場育種實務、基因調控分析、豬隻疾病監控分析、豬隻飼養管理系統、實驗室品質控管、基因轉殖動物生產醫藥用蛋白質、基因體蛋白質體生物資訊分析等等都有多面向的參與,這些工作讓我有機會將自己對數學、統計計算與電腦資訊工具的愛好轉到實際應用層面,如何解決的不只是科學問題,還有實際的現場生產問題,這當中最需要面對的其實是人的問題,這部分比科學還複雜,但是更為有趣,讓我更多體會科學與人文的搭配,以及統計計算如何轉變與多元應用。 來到台大動科系就以生物資訊學為主題,開設多門相關課程,我著重在這些生物資訊工具的實務運用上,搭配原有的動物遺傳育種專長,更能夠在動物領域中發揮所長。因為實驗技術與設備發展上突飛猛進,現在要取得實驗數據已然自動化與機械化,重點是在如何設計最合適的實驗來回答想要解決的問題,這裡要注重的是科學思考邏輯與策略,有了合適的試驗設計,就可以快速進行實驗獲取數據,現下的碩士班研究生往往可以在一年內獲得數倍於以往一位或多位博士班學生的四五年累績數據,但是下一個重點則是搭配先前的試驗設計,要如何分析這麼多數據,還要把實驗的目的抓牢在身邊,否則最後只有在數據海洋中載浮載沉,那就可惜了現代科學技術的發展。 除了生物資訊課程之外,還有參與統計學、動物育種學、基因體學的教學。也主持多個畜產動物的研究計畫,從表現型數據的收集到基因型判定,甚至衍生到功能性基因體的分析等,尤其在國際上各個不同公開生物資訊資料庫(如GenBank, RefSeq, EMBL, GO, Gene Index, UniGene, Ensembl, KEGG pathway等等)的解析與應用,這對基因體或基因調控的研究上會有很大的助益。在畜產業的推廣工作上,我也極盡所能地去協助養豬農民改善其生產效益與解決遺傳育種問題,這樣的工作已經持續十八年,也協助過許多肯努力的業者改善了眾多現場生產與育種問題。
- 五 2, 3, 4
加工204室
2 類
修課總人數 36 人
本校 36 人
無領域專長
- 中文授課
- NTU COOL
- 核心能力與課程規劃關聯圖
- 備註
本校選課狀況
已選上0/36外系已選上0/0剩餘名額0已登記0- 課程概述以實例說明各項動物育種實務工作之重點或所面臨之問題後,再配合理論加以闡述。 Illustration of practice and problems in animal breeding using examples in real situations with theoretical explanation. 課程內容先介紹基本動物育種觀念與目標,再擴充至數量性狀(或多基因性狀)之遺傳方式;並深入探討數量性狀之遺傳評估、遺傳改進、相關選拔反應與多性狀選拔及其在動物育種工作之應用;於動物配種策略方面,依序講授逢機與選型配種、近親配種與遠親配種、雜交育種制度與雜交優勢等。 At first, we will introduce those basic principles and goals of animal breeding. Then, extending to the inheritance pattern of quantitative traits. The methods and applications of genetic evaluation, improvement, correlated response and multiple trait selection will be discussed with randaom/assortative mating, inbred/outbred mating, crossbred mating, and inbreeding/heterosis in mating strategies. 全學期授課單元如下: 1. 動物育種基本觀念與目標 What is the “Best” Animal? 2. 動物族群性能之改良 How are Animal Populations Improved? 3. 數量性狀之遺傳模式 The Genetic Model for Quantitative Traits. 4. 統計在數量性狀之應用 Statistics and Their Application to Quantitative Traits. 5. 遺傳率與重複勢 Heritability and Repeatability. 6. 影響遺傳改變因素 Factors Affecting the Rate of Genetic Change. 7. 遺傳估測與大規模遺傳評估 Genetic Prediction & Large-Scale Genetic Evaluation. 8. 選拔之相關反應 Correlated Response to Selection. 9. 多性狀選拔 Multiple-Trait Selection. 10. 簡單遺傳性狀之配種制度 Selection for Simply-Inherited Traits. 11. 逢機配種與選型配種 Mating Strategies Based on Animal Performance: Random and Assortative Mating. 12. 近親配種與遠親配種 Mating Strategies Based on Pedigree Relationship: Inbreeding and Outbreeding. 13. 雜交優勢 Hybrid Vigor. 14. 雜交育種制度 Crossbreeding Systems.
- 課程目標1. 通盤瞭解育種工作對動物生產作業之重要性 2. 熟悉各項動物育種策略與觀念 3. 掌握各種動物之重要經濟性狀及其遺傳特性 4. 正確使用常用動物育種名詞並熟悉其意義
- 課程要求先修: 統計學、遺傳學
- 預期每週課前或/與課後學習時數三小時閱讀、三小時作業
- Office Hour
*此 Office Hour 需要提前預約 - 指定閱讀1. Bourdon, R. M. 2000. Understanding Animal Breeding. 2nd Ed. Pearson Education. 2. (翻譯)李淵百、池雙慶、戴謙、羅玲玲、林恩仲,2001。動物育種學解析。國立編譯館出版。茂 昌公司經銷。
- 參考書目Van Vleck, L.D., E. J. Pollak, and E. A. B. Oltenacu. 1987. Genetics for the Animal Sciences. W. H. Freeman and Comp., NY, USA.
- 評量方式
20% 作業
本學期約有9~10次作業(homework)
24% 第一次考試
Ch.1~2 & Ch.7~9
28% 第二次考試
Ch.10~14
28% 第三次考試
Ch.15~19
- 本校尚無訂定 A+ 比例上限。
- 本校採用等第制評定成績,學生成績評量辦法中的百分制分數區間與單科成績對照表僅供參考,授課教師可依等第定義調整分數區間。詳見 學習評量專區。
- 針對學生困難提供學生調整方式
調整方式 說明 A2 以錄影輔助
Assisted by video
B1 延長作業繳交期限
Extension of the deadline for submitting assignments
- 補課資訊
- 課程進度
2/23第 1 週 2/23 Ch.1 動物育種基本觀念與目標 Ch.2 動物族群性能之改良 3/1第 2 週 3/1 Ch.2 動物族群性能之改良 Ch.7 數量性狀之遺傳模式 3/8第 3 週 3/8 Ch.7 數量性狀之遺傳模式 Ch.9 遺傳率與重複勢 3/15第 4 週 3/15 Ch.9 遺傳率與重複勢 3/22第 5 週 3/22 第一次考試 Ch.10 影響遺傳改變因素 3/29第 6 週 3/29 Ch.10 影響遺傳改變因素 Ch.11 遺傳估測 4/5第 7 週 4/5 放假一次 (國定假日) 4/12第 8 週 4/12 Ch.11 遺傳估測 Ch.12 大規模遺傳評估 4/19第 9 週 4/19 Ch.12 大規模遺傳評估 Ch.13 選拔之相關反應 4/26第 10 週 4/26 Ch.13 選拔之相關反應 Ch.14 多性狀選拔 5/3第 11 週 5/3 第二次考試 Ch.15 簡單遺傳性狀之配種制度 5/10第 12 週 5/10 Ch.15 簡單遺傳性狀之配種制度 Ch.16 逢機配種與選型配種 5/17第 13 週 5/17 Ch.16 逢機配種與選型配種 Ch.17 近親配種與遠親配種 5/24第 14 週 5/24 Ch.17 近親配種與遠親配種 Ch.18 雜交優勢 5/31第 15 週 5/31 Ch.18 雜交優勢 Ch.19 雜交育種制度 6/7第 16 週 6/7 第三次考試